無細(xì)胞蛋白表達(dá)的興起可將這一時(shí)間縮短至十幾個(gè)小時(shí),但是仍需要現(xiàn)進(jìn)行表達(dá)載體的制備,體外擴(kuò)增和高通量蛋白表達(dá)然后再進(jìn)行篩選等多步操作。Nuclera將這些復(fù)雜的流程ji he到eProteinDiscovery系統(tǒng)。該系統(tǒng)使用基于數(shù)字微流控的智能卡盒、蛋白質(zhì)質(zhì)量檢測(cè)和無細(xì)胞蛋白合成,使研究人員更容易快速獲取高質(zhì)量蛋白質(zhì)。只要將目標(biāo)蛋白質(zhì)的序列輸入配套軟件,就可以利用預(yù)設(shè)融合標(biāo)簽定制DNA構(gòu)建體以優(yōu)化表達(dá),然后將表達(dá)載體裝載到機(jī)器上,該系統(tǒng)就會(huì)通過自動(dòng)化構(gòu)建篩選(可同時(shí)篩24種DNA構(gòu)建體x8種無細(xì)胞混合物=192種獨(dú)特表達(dá)條件),根據(jù)可溶性、可純化性和純化產(chǎn)量數(shù)據(jù)確定Zui 佳表達(dá)條件,然后放大規(guī)模并獲取蛋白質(zhì)以供下游應(yīng)用,從DNA到可用于分析檢測(cè)的蛋白質(zhì)只需要48小時(shí)。系統(tǒng)已生產(chǎn)超過2,000種蛋白質(zhì),包含多種類型,其中約77%的人類蛋白。蛋白質(zhì)類型包括伴侶蛋白、水解酶、連接酶、氧化還原酶、信號(hào)蛋白、結(jié)構(gòu)蛋白和轉(zhuǎn)移酶等,分子量范圍為18kDa~300kDa(平均:46kDa)。獲得的難表達(dá)蛋白包括膜蛋白、含二硫鍵的蛋白和含高度無序結(jié)構(gòu)的蛋白等,還更容易地篩選和獲取同源物、直系同源物、突變和異構(gòu)體。對(duì)于需糖基化的抗體,??哺乳細(xì)胞體外表達(dá)??比原核系統(tǒng)更適用。外源蛋白表達(dá)產(chǎn)業(yè)鏈
傳統(tǒng)的蛋白質(zhì)表達(dá)純化流程極其依賴人工操作,并且往往需要幾周或者幾個(gè)月的時(shí)間.無細(xì)胞蛋白表達(dá)的興起可將這一時(shí)間縮短至十幾個(gè)小時(shí),但是仍需要現(xiàn)進(jìn)行表達(dá)載體的制備,體外擴(kuò)增和高通量蛋白表達(dá)然后再進(jìn)行篩選等多步操作。Nuclera將這些復(fù)雜的流程ji he到eProteinDiscovery系統(tǒng).該系統(tǒng)使用基于數(shù)字微流控的智能卡盒、蛋白質(zhì)質(zhì)量檢測(cè)和無細(xì)胞蛋白合成,使研究人員更容易快速獲取高質(zhì)量蛋白質(zhì)。只要將目標(biāo)蛋白質(zhì)的序列輸入配套軟件,就可以利用預(yù)設(shè)融合標(biāo)簽定制DNA構(gòu)建體以優(yōu)化表達(dá),然后將表達(dá)載體裝載到機(jī)器上,該系統(tǒng)就會(huì)通過自動(dòng)化構(gòu)建篩選(可同時(shí)篩24種DNA構(gòu)建體x8種無細(xì)胞混合物=192種獨(dú)特表達(dá)條件),根據(jù)可溶性、可純化性和純化產(chǎn)量數(shù)據(jù)確定Zui佳表達(dá)條件,然后放大規(guī)模并獲取蛋白質(zhì)以供下游應(yīng)用,從DNA到可用于分析檢測(cè)的蛋白質(zhì)只需要48小時(shí)。系統(tǒng)已生產(chǎn)超過2,000種蛋白質(zhì),包含多種類型,其中約77%的人類蛋白。蛋白質(zhì)類型包括伴侶蛋白、水解酶、連接酶、氧化還原酶、信號(hào)蛋白、結(jié)構(gòu)蛋白和轉(zhuǎn)移酶等,分子量范圍為18kDa~300kDa(平均:46kDa)。獲得的難表達(dá)蛋白包括膜蛋白、含二硫鍵的蛋白和含高度無序結(jié)構(gòu)的蛋白等,還更容易地篩選和獲取同源物、直系同源物、突變和異構(gòu)體.iptg誘導(dǎo)蛋白表達(dá)實(shí)驗(yàn)流程當(dāng)體外蛋白表達(dá)效率不足時(shí),需檢測(cè)模板完整性并優(yōu)化啟動(dòng)子強(qiáng)度。
20世紀(jì)90年代后,隨著分子生物學(xué)和合成生物學(xué)的進(jìn)步,無細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù)技術(shù)迎來突破。研究者通過優(yōu)化裂解物制備(如敲除大腸桿菌核酸酶)、開發(fā)能量再生系統(tǒng)(如Phosphoenolpyruvic acid,PEP循環(huán)),明顯提升蛋白產(chǎn)量和反應(yīng)時(shí)長。2000年代初,連續(xù)交換式反應(yīng)體系(CECF)的出現(xiàn)解決了底物耗盡問題,使反應(yīng)時(shí)間延長至24小時(shí)以上,產(chǎn)量達(dá)毫克級(jí),為工業(yè)化鋪平道路。此階段,無細(xì)胞蛋白表達(dá)技術(shù)開始應(yīng)用于毒性蛋白合成和抗體片段生產(chǎn),但成本仍較高。
只要將目標(biāo)蛋白質(zhì)的序列輸入配套軟件,就可以利用預(yù)設(shè)融合標(biāo)簽定制DNA構(gòu)建體以優(yōu)化表達(dá),然后將表達(dá)載體裝載到機(jī)器上,該系統(tǒng)就會(huì)通過自動(dòng)化構(gòu)建篩選(可同時(shí)篩24種構(gòu)建體 x 8種無細(xì)胞混合物=192種表達(dá)條件),在48小時(shí)內(nèi),根據(jù)可溶性、可純化性和純化產(chǎn)量數(shù)據(jù)確定Zui佳表達(dá)條件,然后放大規(guī)模并獲取蛋白質(zhì)以供下游應(yīng)用。該工作流程只需3步,可生產(chǎn)18kDa~300kDa的蛋白質(zhì),還更容易地篩選和獲取同源物、直系同源物、突變和異構(gòu)體。nucleraeProteinDiscovery工作流程:1.設(shè)計(jì)與準(zhǔn)備:將蛋白質(zhì)序列輸入軟件,利用預(yù)設(shè)融合標(biāo)簽設(shè)計(jì)構(gòu)建體,并使用eGene制備試劑盒制備表達(dá)構(gòu)建體。2.表達(dá)與純化:自動(dòng)化篩選192種表達(dá)條件以評(píng)估可溶性產(chǎn)量,再從其中選取30種進(jìn)行strep-tag可純化性評(píng)估,依據(jù)篩選數(shù)據(jù)確定Zui優(yōu)eGene/無細(xì)胞混合組合,整個(gè)過程快速效率高,為后續(xù)研究奠定基礎(chǔ)。3.放大與應(yīng)用:基于篩選結(jié)果對(duì)蛋白質(zhì)進(jìn)行微克至毫克級(jí)別的放大生產(chǎn),Zui終獲得高純度蛋白質(zhì),滿足不同實(shí)驗(yàn)需求。添加0.5mM PMSF將 ??體外表達(dá)蛋白的降解率??從45%壓制至<5%。
盡管體外蛋白表達(dá)在科研領(lǐng)域優(yōu)勢(shì)明顯,其規(guī)?;瘧?yīng)用仍面臨三重挑戰(zhàn):裂解物制備成本高: 真核裂解物(如兔網(wǎng)織紅細(xì)胞)的原料獲取與標(biāo)準(zhǔn)化生產(chǎn)難度大,單位成本遠(yuǎn)超微生物發(fā)酵;反應(yīng)體系穩(wěn)定性不足: 蛋白酶/核酸酶導(dǎo)致的產(chǎn)物降解及底物(如ATP)快速耗竭限制持續(xù)合成時(shí)間;產(chǎn)物濃度天花板: 當(dāng)前比較好工藝的蛋白產(chǎn)量約5g/L,較CHO細(xì)胞系統(tǒng)(>10g/L)存在差距。解決這些瓶頸需開發(fā) 工程化裂解物(如RNase缺陷型菌株)與連續(xù)流灌注技術(shù),提升經(jīng)濟(jì)可行性自供能體外蛋白表達(dá)??系統(tǒng)是構(gòu)建人工細(xì)胞的重要路徑。大分子蛋白表達(dá)陽性
??兔網(wǎng)織紅細(xì)胞裂解物??(RRL)和??小麥胚芽裂解物??(WGE)是兩類常見真核平臺(tái),用于體外蛋白表達(dá).外源蛋白表達(dá)產(chǎn)業(yè)鏈
體外蛋白表達(dá)系統(tǒng)的hexin在于重構(gòu)細(xì)胞質(zhì)環(huán)境中的核糖體翻譯機(jī)器。該過程起始于mRNA5'端與核糖體小亞基的結(jié)合,由起始因子(如原核IF1/2/3或真核eIF4F復(fù)合物)介導(dǎo)形成翻譯起始復(fù)合物。肽鏈延伸階段依賴延伸因子EF-Tu準(zhǔn)確運(yùn)送氨酰tRNA至A位點(diǎn),并通過其GTP水解活性確保密碼子-反密碼子配對(duì)的保真度。體外蛋白表達(dá)的高效率源于反應(yīng)底物濃度的可調(diào)控性—在去除了細(xì)胞膜屏障的無細(xì)胞環(huán)境中,ATP濃度可提升至生理水平的5-8倍(4-6mM),使核糖體延伸速率高達(dá)21個(gè)氨基酸/秒。同時(shí),磷酸肌酸(PCr)-肌酸激酶(CK)組成的能量再生系統(tǒng)持續(xù)將ADP還原為ATP,維持反應(yīng)體系48小時(shí)以上的持續(xù)活性,大幅提升了目標(biāo)產(chǎn)物的積累效率。外源蛋白表達(dá)產(chǎn)業(yè)鏈