遼寧空間代謝組學與空間轉(zhuǎn)錄組

空間代謝組學研究作者對P493-6B細胞淋巴瘤系（BCL）進行了全基因組表達譜、核突變和ChIP分析，發(fā)現(xiàn)MYC誘導增加了包括ACLY、ACACA、FASN和SCD1及其相關蛋白在內(nèi)的脂肪酸（FA）合成基因的mRNA表達，在MYC誘導的肝細胞*（HCC）、急性白血?。═-ALL）和腎細胞*（RCC）的三種體內(nèi)轉(zhuǎn)基因小鼠模型中也有類似表達。還發(fā)現(xiàn)MYC與這些FA合成基因的啟動子結(jié)合并啟動mRNA轉(zhuǎn)錄，如甲羥戊酸和膽固醇途徑基因的啟動子。為了了解MYC和SREBP1之間的相互作用，作者首先，對這兩種蛋白進行ChIP和re-ChIP分析，證明MYC和SREBP1都可以發(fā)現(xiàn)與FA合成基因啟動子中的相同DNA分子結(jié)合（圖1）。SREBP1的敲低也降低了FA合成基因的表達，但不降低MYC基因的表達。其次，ChIP的MYC與啟動子結(jié)合，不僅調(diào)節(jié)FA合成基因的表達，還調(diào)節(jié)糖酵解和谷氨酰胺分解基因的表達。因此，MYC似乎會依次調(diào)節(jié)參與脂質(zhì)合成的基因：首先誘導葡萄糖和谷氨酰胺，然后誘導FA合成相關基因。通過RNA測序（RNA-seq）發(fā)現(xiàn)，增加MYC水平會引起糖酵解、谷氨酰胺分解和FA合成。空間代謝組三個維度的分析。遼寧空間代謝組學與空間轉(zhuǎn)錄組

空間代謝組學：中文標題：MYC*基因與固醇調(diào)節(jié)元件結(jié)合蛋白協(xié)同調(diào)節(jié)**生長所必需的脂肪生成研究對象：小鼠發(fā)表期刊：CellMetabolism影響因子：27.287合作單位：斯坦福大學運用生物技術：空間代謝組學、CHIP、RNA-seq、NMR和IHC等MYC是一種原*基因，在細胞增殖、凋亡、分化等多種細胞生物學過程中發(fā)揮作用，其易位、擴增或表達異常常與多種**的發(fā)***展有關。近年來關于MYC在脂質(zhì)代謝中的研究很多，據(jù)了解MYC與脂肪酸合成相關酶密切相關；致*基因MYC刺激細胞生長需要脂質(zhì)來組裝新的細胞膜，但是否*由MYC調(diào)節(jié)還是與其他因素協(xié)同調(diào)節(jié)尚不清楚。因此本文主要是揭示MYC誘導的**中脂質(zhì)生成的機制。重慶空間代謝組學與空間轉(zhuǎn)錄組歐易生物空間代謝組學適合整體方案,助力科研,。

以上結(jié)果表明，AFADESI-MSI方法可以直接檢測極性代謝產(chǎn)物，并具有高特異性，能呈現(xiàn)其在大腦微區(qū)分布的圖像。3.在大鼠腦中繪制微區(qū)代謝網(wǎng)絡圖要了解大腦的結(jié)構(gòu)區(qū)域發(fā)生的復雜代謝過程，不僅應準確表征代謝物，還要研究其相關性。從大鼠腦微區(qū)中提取代謝譜進行代謝網(wǎng)絡重建。從15個微區(qū)提取的MSI數(shù)據(jù)進行峰挑選和峰對齊（圖1F），包括松果體、中腦導水管、腦橋、梨狀皮質(zhì)、延髓、丘腦、紋狀體、海馬、胼胝體、嗅球、大腦皮層、小腦皮層、穹窿、小腦延髓和丘腦。

空間代謝組學：食道腺*是全球第八大崔常見的惡性**發(fā)病率正在持續(xù)上升，但存活率仍然很低，目前急需新的工具來提高早期診斷和精確***。脂質(zhì)代謝紊亂與**的發(fā)***展密切相關，大多數(shù)脂質(zhì)以甘油磷脂（GPLs）的形式儲存在雙分子膜中，基于甘油磷脂具有較穩(wěn)定的物理化學性質(zhì)，因此將其作為疾病診斷的生物標志物具有重要意義。質(zhì)譜成像(MSI)可在幾分鐘內(nèi)對冷凍切片組織的**磷脂體量化并進行客觀診斷。然而，MSI是否能客觀識別原發(fā)性食管腺*目前尚不清楚，這是一個重大的挑戰(zhàn)，因為該微環(huán)境復雜，組織類型的表型相似?？臻g代謝組學 技術咨詢中心。

空間代謝組學：質(zhì)譜成像技術近二十年來，隨著質(zhì)譜離子化技術的不斷發(fā)展，質(zhì)譜成像技術因其能夠直觀、快速、簡便地呈現(xiàn)出分子在細胞或組織中的結(jié)構(gòu)、空間與時間分布等信息，越來越受到大家的關注。并且質(zhì)譜成像技術也被***的用在**疾病研究、藥物前期發(fā)現(xiàn)等各領域的高質(zhì)量文章中，為生物標志物的高靈敏度探測和藥物代謝精確成像研究奠定了基礎，下面進入到質(zhì)譜“畫”時代~是什么？有多少？在哪里？回答以上“靈魂”3問，首先需要了解他們之間的關系。質(zhì)譜是通過采集化合物的質(zhì)荷比，獲得定性和定量的信息，進而去探究物質(zhì)本身包含的化合物“是什么？”和“有多少？”這兩個根本性問題?！犊臻g代謝組科研應用手冊》是一本集聚空間代謝組學的由來、發(fā)展、原理及應用的科研專業(yè)讀物。貴州空間代謝組學翻譯

質(zhì)譜成像空間代謝組學方法及其應用研究進展。遼寧空間代謝組學與空間轉(zhuǎn)錄組

空間代謝組學研究：一區(qū) | IF:14.553多發(fā)性硬化癥的相關空間代謝組學研究。本文為倫敦帝國理工學院Zoltan Takats教授課題組在ACS central science期刊發(fā)表的題為“Correlated Heterospectral Lipidomics for Biomolecular Profiling of Remyelination in Multiple Sclerosis"的研究成果，通過拉曼+空間代謝組學+IHC研究方法，發(fā)現(xiàn)了新形成的髓鞘與正常髓鞘具有不同的脂質(zhì)成分，探究了多發(fā)性硬化中再髓鞘化形成的機理，描繪了用于關聯(lián)生物分子結(jié)構(gòu)和髓鞘成分的分子成像圖譜，為評估再髓鞘化***提供新策略。遼寧空間代謝組學與空間轉(zhuǎn)錄組

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