隊(duì)列1：收集手術(shù)切除的食管腺*（EA）組織和與之匹配的健康食管上皮組織（MHEE）。隊(duì)列2：收集健康食管上皮組織（來(lái)自健康志愿者，HEE）和未經(jīng)***的食管炎（IEE）、巴雷特化生（BM）、巴雷特增生（BD）和食管腺*（EA）活檢樣本，用于發(fā)現(xiàn)食管腺*發(fā)展進(jìn)程中甘油磷脂的變化，以及隊(duì)列1的外部驗(yàn)證。樣本制備：樣本制成冰凍組織切片，并結(jié)合H&E染色。研究方法：空間代謝組學(xué)；qPCR檢測(cè)甘油磷脂合成通路中基因的表達(dá)；細(xì)胞轉(zhuǎn)染沉默ACYL基因；免疫組化用于分析隊(duì)列1樣本中脂肪酸從頭合成通路關(guān)鍵酶的表達(dá)。曾經(jīng)錯(cuò)過(guò)熱潮—空間轉(zhuǎn)錄組,別再錯(cuò)過(guò)新秀—空間代謝組。河北空間代謝組學(xué)公司
1.AFADESI-MSI用于大腦中極性代謝物的定位如圖1所示，將大鼠大腦連續(xù)矢狀切面通過(guò)ESI探針對(duì)逐個(gè)像素進(jìn)行掃描，并將解吸的代謝物離子傳輸?shù)礁叻直媛寿|(zhì)量分析儀進(jìn)行分析。圖1E是大鼠腦部某個(gè)像素點(diǎn)的一個(gè)代表性質(zhì)譜圖，在該圖中可以觀察到數(shù)千個(gè)代謝物的峰。AFADESI-MSI圖像還表明腦部不同功能性區(qū)域中代謝物濃度的變化。圖1A-D顯示了代表性代謝產(chǎn)物圖像，在松果體、紋狀體、海馬、胼胝體和嗅球等亞區(qū)域具有特定分布。這些異質(zhì)代謝分布與大鼠腦的功能和結(jié)構(gòu)復(fù)雜性高度一致。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，AFADESI-MSI的空間分辨率小于100μm，代謝物質(zhì)量比較大差異為0.001Da，同一物質(zhì)的檢測(cè)動(dòng)態(tài)范圍高達(dá)1000倍。如圖1所示，通過(guò)AFADESI-MSI可在大鼠腦部檢測(cè)到一些呈特征性分布有代表性的極性代謝物，其強(qiáng)度范圍從0到104甚至到106。湖北空間代謝組學(xué) 英語(yǔ)空間分辨代謝組學(xué)代謝組相關(guān)材料。
空間代謝組學(xué)：在大鼠腦繪制特定區(qū)域分布的極性代謝物圖譜使用AFADESI-MSI在正離子和負(fù)離子模式下分別獲得298個(gè)和372個(gè)微區(qū)輪廓清晰的代謝物離子圖像。使用精確分子量并結(jié)合同位素豐度，通過(guò)人類代謝組數(shù)據(jù)庫(kù)（HMDB）對(duì)離子圖像進(jìn)行識(shí)別，鑒定出多種內(nèi)源極性代謝物，包括氨基酸、核苷酸或核苷、碳水化合物、脂肪酸和神經(jīng)遞質(zhì)等。***系統(tǒng)（CNS）的特定功能和特定解剖區(qū)域相關(guān)。例如，乙酰膽堿在大腦皮層中高度表達(dá)；γ-氨基丁酸是一種抑制性神經(jīng)遞質(zhì)，其在大腦皮層的信號(hào)強(qiáng)度較低，在中腦、嗅球和下丘腦中的濃度較高。
本文作者開(kāi)發(fā)的一種基于敞開(kāi)式空氣動(dòng)力輔助解吸電噴霧離子化質(zhì)譜成像（AFADESI-MSI）的空間代謝組學(xué)技術(shù)，可以實(shí)現(xiàn)大腦功能區(qū)域小分子極性代謝物的檢測(cè)，發(fā)掘微區(qū)特定代謝途徑的變化；結(jié)合代謝網(wǎng)絡(luò)映射方法，對(duì)大鼠腦的代謝網(wǎng)絡(luò)作圖，并用于東莨菪堿***的阿爾茨海默病模型大腦微區(qū)的病理過(guò)程解析。這篇文章證實(shí)了空間代謝組學(xué)技術(shù)在神經(jīng)學(xué)發(fā)展、行為與認(rèn)知、精神與退行性疾病以及腦**研究領(lǐng)域的廣泛應(yīng)用前景。大腦的結(jié)構(gòu)極為復(fù)雜，且主要功能區(qū)域的調(diào)節(jié)機(jī)制與小分子代謝物密切相關(guān)。基于色譜-質(zhì)譜聯(lián)用的傳統(tǒng)代謝組學(xué)方法無(wú)法滿足大腦復(fù)雜微區(qū)代謝物的定性、定量和定位表征的需求?？臻g代謝組學(xué)找出其代謝物的差異,提供定量檢測(cè)。
空間代謝組學(xué)：利用基質(zhì)進(jìn)行空間成像——MALDI質(zhì)譜分子成像技術(shù)MALDI-MSI分析中非常關(guān)鍵的一點(diǎn)是需要添加基質(zhì)來(lái)吸收激光能量，實(shí)現(xiàn)被測(cè)物的離子化，主要對(duì)脂質(zhì)類化合物具有較好的分析效果， 空間分辨率比較高可以達(dá)到數(shù)個(gè)微米。其中，MALDI和DESI成像技術(shù)目前屬于比較完善，使用范圍較廣的成像技術(shù)。這兩種技術(shù)與質(zhì)譜相連，使用范圍有一定的互補(bǔ)性。二者結(jié)合使用，可實(shí)現(xiàn)“全譜圖分子成像”，相信也有很多老師想要了解這二種成像方式有什么特點(diǎn)呢？空間代謝組特異性強(qiáng)等優(yōu)點(diǎn)。安徽空間代謝組學(xué)價(jià)格
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以上結(jié)果表明，AFADESI-MSI方法可以直接檢測(cè)極性代謝產(chǎn)物，并具有高特異性，能呈現(xiàn)其在大腦微區(qū)分布的圖像。3.在大鼠腦中繪制微區(qū)代謝網(wǎng)絡(luò)圖要了解大腦的結(jié)構(gòu)區(qū)域發(fā)生的復(fù)雜代謝過(guò)程，不僅應(yīng)準(zhǔn)確表征代謝物，還要研究其相關(guān)性。從大鼠腦微區(qū)中提取代謝譜進(jìn)行代謝網(wǎng)絡(luò)重建。從15個(gè)微區(qū)提取的MSI數(shù)據(jù)進(jìn)行峰挑選和峰對(duì)齊（圖1F），包括松果體、中腦導(dǎo)水管、腦橋、梨狀皮質(zhì)、延髓、丘腦、紋狀體、海馬、胼胝體、嗅球、大腦皮層、小腦皮層、穹窿、小腦延髓和丘腦。河北空間代謝組學(xué)公司
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