TMT蛋白質(zhì)組學探究案例:2021年9月,安徽農(nóng)業(yè)大學張照亮教授課題組在Journal of Agricultural and Food Chemistry期刊發(fā)表了題為“Nitrogen-Regulated Theanine and Flavonoid Biosynthesis in Tea Plant Roots: Protein-Level Regulation Revealed by Multiomics Analyses”的研究成果,通過TMT蛋白質(zhì)組學和泛素化蛋白質(zhì)組學研究方法,發(fā)現(xiàn)了氮缺乏條件下茶樹根部響應的差異表達蛋白和泛素化蛋白質(zhì),為茶氨酸和黃酮類生物合成的調(diào)控提供了新的見解,為茶樹翻譯后修飾調(diào)控次生代謝的研究提供了理論依據(jù)。蛋白驗證新技術-PRM,平行反應監(jiān)視蛋白組學。天津蛋白組學一個多少錢
在本研究中,利用iTRAQ標記定量蛋白組學方法對東京野茉莉種子發(fā)育的4個時間點采樣進行蛋白質(zhì)組學分析。獲得了2338個蛋白和1473個DEPs。Mfuzz聚類分析顯示,在種子發(fā)育過程中,轉(zhuǎn)錄本和蛋白質(zhì)組之間存在相當大的時序一致性。在四個發(fā)育時期中,花后70天(種子發(fā)育活躍期)是視為東京野茉莉種仁發(fā)育的關鍵時期:在該階段與脂肪酸生物合成相關的功能基因和酶蛋白均達到表達峰值,同時種仁內(nèi)部大部分營養(yǎng)物質(zhì)開始迅速積累。通過轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)綜合分析油脂合成的調(diào)控網(wǎng)絡,乙酰CoA羧化酶和**酸脫氫酶兩個酶體系處于中心位置,在脂肪酸的合成過程中具有主導作用。浙江哪些機構可以做蛋白組學測定質(zhì)譜技術,生物信息學方法,提供蛋白質(zhì)組學 。
蛋白質(zhì)組定量到了10,529種蛋白質(zhì),磷酸化蛋白質(zhì)組定量到了來自9,832個磷酸化蛋白的62,879個磷酸化位點?;蚪M確定了包括TP53、KRAS、FGFR2、IDH1/2、BAP1、ARID1A和PBRM1在內(nèi)的16個***改變的**驅(qū)動基因(圖1A)。與西方iCCA人群隊列相比,本文隊列顯示出更高的KRAS突變頻率和更低的IDH1、ARID1A和TERT突變頻率(圖1B)。在FU-iCCA隊列中觀察到黃曲霉***和馬兜鈴酸特征(圖1C)。通過比較具有或不具有黃曲霉***特征的所有**的多組學數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)具有黃曲霉***特征的**顯示出DNA修復和細胞周期通路的上調(diào)以及細胞凋亡、***炎癥和免疫通路的下調(diào)(圖1E)。進一步分析顯示,TP53突變與黃曲霉***特征***相關(圖1F和1G)。
蛋白組學技術是以蛋白質(zhì)組為研究對象,研究細胞、組織或生物體蛋白質(zhì)組成及其變化規(guī)律的科學。DIA作為一種新的質(zhì)譜數(shù)據(jù)采集方式穩(wěn)定性高,覆蓋度廣的優(yōu)點。DIA蛋白組學技術已經(jīng)越來越多的疾病研究中發(fā)揮重大作用。本研究通過DIA蛋白組學技術分析了8個SAPHO病人和8個健康人的蛋白表達譜。蛋白表達的相關性圖顯示組內(nèi)相關性良好,差異蛋白的PCA圖顯示兩組得到明顯的區(qū)分。蛋白質(zhì)組學通過研究生物樣本中蛋白質(zhì)組成和變化,從而推動疾病的病理機制研究,為臨床診斷和預后提供潛在生物標志物。TMT/iTRAQ標記定量蛋白組學 差異表達蛋白質(zhì)組分析研究。
作者通過泛素化蛋白組學分析鑒定了茶樹作根中的泛素化蛋白質(zhì)。中文標題:氮調(diào)節(jié)茶樹根中茶氨酸和黃酮類化合物的生物合成:多組學分析揭示的蛋白質(zhì)水平調(diào)節(jié)研究對象:茶樹根發(fā)表期刊:JournalofAgriculturalandFoodChemistry影響因子:5.279發(fā)表時間:2021年9月1日發(fā)表單位:安徽農(nóng)業(yè)大學運用生物技術:TMT蛋白質(zhì)組學、泛素化蛋白質(zhì)組學(其中部分數(shù)據(jù)分析由鹿明生物提供技術支持)。本文分析了氮缺乏下茶樹根部的茶氨酸和黃酮類代謝,通過蛋白質(zhì)組和泛素化蛋白質(zhì)組結合轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)探索了調(diào)節(jié)機制。本文的多組學數(shù)據(jù)整合分析思路值得借鑒。單細胞蛋白組學之質(zhì)譜流式細胞技術。浙江哪些機構可以做蛋白組學測定
單細胞蛋白質(zhì)組學,極微量樣本檢測。天津蛋白組學一個多少錢
3篇經(jīng)典的蛋白組學和代謝組學在水產(chǎn)動物中的研究。水產(chǎn)動物的研究不僅是保障我國海水養(yǎng)殖業(yè)的健康可持續(xù)發(fā)展,同時可為良種創(chuàng)制、海洋環(huán)境研究、生態(tài)研究等提供重要理論基礎和技術支撐~因此在水產(chǎn)生物研究方面蛋白組學、代謝組學在其中起到什么作用呢?期望這3篇經(jīng)典文章能給您思路~中文標題:CO2誘導的海洋酸化損害了太平洋牡蠣對金氏弧菌的免疫功能:細胞和蛋白質(zhì)組學的綜合研究研究對象:牡蠣發(fā)表期刊:ScienceoftheTotalEnvironment影響因子:6.551合作單位:中國科學院海岸帶研究所運用歐易/鹿明生物技術:iTRAQ標記定量蛋白質(zhì)組學(由鹿明生物提供技術支持)天津蛋白組學一個多少錢
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