在基因編輯技術(shù)蓬勃發(fā)展的時(shí)代,人類仿佛獲得了一把能夠重塑生命密碼的神奇鑰匙。從基礎(chǔ)科研對(duì)基因功能的深度探索,到生物制藥領(lǐng)域?qū)σ呻y病癥的突破嘗試,基因編輯技術(shù)正以前所未有的速度改變著生物醫(yī)學(xué)的格局。然而,如同每一枚硬幣都有兩面,基因編輯技術(shù)在帶來(lái)無(wú)限可能的同時(shí),也隱藏著一個(gè)不容忽視的隱患——脫靶效應(yīng)。上海唯可生物科技有限公司,作為一家專注于生物技術(shù)前沿研究與應(yīng)用的企業(yè),敏銳地捕捉到了這一關(guān)鍵問題,并投身于脫靶檢測(cè)領(lǐng)域,為基因編輯技術(shù)的安全應(yīng)用筑牢防線。種子基因脫靶檢測(cè)機(jī)構(gòu)推薦唯可。蘇州off-target脫靶檢測(cè)政策
不論在科研還是臨床中,CRISPR技術(shù)的使用都帶來(lái)了非常高的回報(bào),也同時(shí)伴隨著各種風(fēng)險(xiǎn),這其中脫靶現(xiàn)象就研究者們較為擔(dān)心的一類風(fēng)險(xiǎn)。本文中我們盤點(diǎn)了多種主流的CRISPR脫靶位點(diǎn)檢測(cè)方法,但沒有一種方法是適用于所有CRISPR技術(shù)的脫靶檢測(cè),一個(gè)項(xiàng)目中只使用一種脫靶檢測(cè)方法也是不足夠的。如何在實(shí)驗(yàn)中,特別是臨床試驗(yàn)中多方面評(píng)估CRISPR的脫靶風(fēng)險(xiǎn),需要將多種脫靶檢測(cè)方法有效組合。同時(shí),每一條sgRNA都不可避免地存在脫靶位點(diǎn),如何評(píng)估這種風(fēng)險(xiǎn),如何降低這種風(fēng)險(xiǎn),具體的解決方案我們用臨床實(shí)例來(lái)為大家介紹。杭州高精度脫靶檢測(cè)企業(yè)種子脫靶檢測(cè),推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。
圍繞大家關(guān)心的CRISPR基因編輯安全性問題,我們首先對(duì)CRISPR脫靶位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)進(jìn)行一次大盤點(diǎn),在sgRNA設(shè)計(jì)階段需要如何做才能夠盡可能地避免脫靶現(xiàn)象的發(fā)生。較簡(jiǎn)單的脫靶位點(diǎn)檢測(cè)方法是全基因組測(cè)序(WGS),但在實(shí)際使用中,即使測(cè)序深度達(dá)到100X,也很難發(fā)現(xiàn)一些低頻率的脫靶位點(diǎn),同時(shí)測(cè)序成本卻非常高。為彌補(bǔ)WGS的這些缺陷,常見的脫靶位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)都需要對(duì)脫靶位點(diǎn)進(jìn)行捕獲富集,來(lái)提高檢測(cè)靈敏度,降低測(cè)序成本。按照實(shí)驗(yàn)原理的不同,脫靶位點(diǎn)檢測(cè)技術(shù)可以分為細(xì)胞外、細(xì)胞內(nèi)和其他特殊方法這3類。
基于已有科學(xué)經(jīng)驗(yàn)和既往非臨床/臨床研究結(jié)果,如果認(rèn)為基因修飾細(xì)胞所采用的載體系統(tǒng)可將外源基因整合到細(xì)胞基因組中并可在體內(nèi)長(zhǎng)期存續(xù),需綜合分析以上風(fēng)險(xiǎn)因素,評(píng)估潛在的插入突變、致瘤/致性風(fēng)險(xiǎn)。非臨床研究,應(yīng)采用具有代表性的基因轉(zhuǎn)導(dǎo)細(xì)胞進(jìn)行基因整合位點(diǎn)分析,分析細(xì)胞的克隆組成以及在關(guān)注基因(如liu相關(guān)調(diào)控基因)附近有無(wú)優(yōu)先整合跡象,含有關(guān)注整合位點(diǎn)的細(xì)胞有無(wú)優(yōu)先異常增殖。對(duì)于嵌合抗原受體(Chimericantigenreceptor,CAR)或T細(xì)胞受體(Tcellreceptor,TCR)修飾的免疫細(xì)胞,應(yīng)盡可能采用多種方法評(píng)估其靶點(diǎn)相關(guān)毒性和脫靶毒性風(fēng)險(xiǎn)。脫靶檢測(cè)guide-sequence,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。
Cas9蛋白是一種切割外來(lái)DNA的酶,像一把分子剪刀。該蛋白通常與兩個(gè)RNA分子結(jié)合:crRNA和另一個(gè)稱為tracrRNA(或“反式j(luò)ihuocrRNA”)。這兩個(gè)RNA分子引導(dǎo)Cas9到它將進(jìn)行切割的目標(biāo)部位。這段DNA是與crRNA的20個(gè)核苷酸互補(bǔ)的。CRISPR技術(shù)是從細(xì)菌和古細(xì)菌的自然防御機(jī)制中改編而來(lái)的。這些生物體使用CRISPR衍生的RNA和各種Cas蛋白,包括Cas9,來(lái)阻止病毒和其他異物的攻擊。它們主要通過(guò)切碎和破壞外來(lái)入侵者的DNA來(lái)做到這一點(diǎn)。當(dāng)這些組件被轉(zhuǎn)移到其他更復(fù)雜的生物體中時(shí),它允許對(duì)基因進(jìn)行操縱,或“編輯”。影響CRISPR靶向性效率和特異性的因素有哪些?深圳高精度脫靶檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室
挑選前面的潛在脫靶位點(diǎn),通過(guò)PCR測(cè)序驗(yàn)證是否脫靶。蘇州off-target脫靶檢測(cè)政策
脫靶檢測(cè)的應(yīng)用5.1 基因編輯工具開發(fā)在新編輯工具開發(fā)過(guò)程中,脫靶檢測(cè)是評(píng)估工具特異性的關(guān)鍵步驟。通過(guò)比較不同工具的脫靶譜,可以篩選出高特異性編輯系統(tǒng)。5.2 基因編輯實(shí)驗(yàn)優(yōu)化在具體實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)中,脫靶檢測(cè)可以幫助選擇特異性高的gRNA序列,優(yōu)化編輯條件,降低脫靶風(fēng)險(xiǎn)。5.3 安全性評(píng)估對(duì)于基因編輯技術(shù)的應(yīng)用,特別是涉及臨床應(yīng)用的研究,脫靶檢測(cè)是安全性評(píng)估的重要組成部分。當(dāng)前脫靶檢測(cè)技術(shù)仍面臨一些挑戰(zhàn)。部分方法靈敏度有限,難以檢測(cè)低頻脫靶事件;一些體內(nèi)檢測(cè)方法操作復(fù)雜,成本較高;生物信息學(xué)預(yù)測(cè)工具的準(zhǔn)確性有待提高。蘇州off-target脫靶檢測(cè)政策