深圳種子脫靶檢測(cè)評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)

來(lái)源: 發(fā)布時(shí)間:2024-06-08

由于設(shè)計(jì)的sgRNA會(huì)與非靶點(diǎn)DNA序列錯(cuò)配,引入非預(yù)期的基因突變,即脫靶效應(yīng)(Off-targeteffects)。脫靶效應(yīng)造成了研究中的許多不確定性,這無(wú)疑限制了該技術(shù)的應(yīng)用。因此,研究者希望能開(kāi)發(fā)有效的方法來(lái)檢測(cè)脫靶效應(yīng)。在目前主流的脫靶效應(yīng)評(píng)估方法中,有一種方法為GUIDE-seq,其原理是利用一種短的雙鏈寡聚核苷酸(dsODN)標(biāo)記CRISPR/Cas誘導(dǎo)的脫靶斷裂,然后對(duì)標(biāo)簽所在的基因組區(qū)域進(jìn)行高通量測(cè)序,通過(guò)生物信息學(xué)分析從而確定脫靶位點(diǎn)。利用該技術(shù)可以在基因組范圍內(nèi)檢測(cè)CRISPR脫靶效應(yīng),從而改變了以往先預(yù)測(cè)假定脫靶位點(diǎn)再檢測(cè)的思路;與其他的評(píng)估方法相比,GUIDE-seq更精確、更靈敏。高深度全基因組重測(cè)序服務(wù),該方法能多方位精細(xì)地對(duì)基因編輯的細(xì)胞或個(gè)體進(jìn)行off-target檢測(cè)。深圳種子脫靶檢測(cè)評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)

深圳種子脫靶檢測(cè)評(píng)估標(biāo)準(zhǔn),脫靶檢測(cè)

基因zhiliao產(chǎn)品特有的可能會(huì)引起遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)因素包括:基因組整合活性基因zhiliao產(chǎn)品可能會(huì)采用修飾宿主基因組的技術(shù),并有可能在宿主細(xì)胞或組織中持續(xù)存在。很多基因zhiliao載體的基因整合不會(huì)指向基因組的特定位點(diǎn),可能在整合位點(diǎn)處產(chǎn)生插入突變、或jihuo整合位點(diǎn)附近的原基因等,進(jìn)而破壞重要基因功能或增加惡性liu的風(fēng)險(xiǎn),例如,國(guó)外已有多項(xiàng)研究報(bào)告在接受了使用γ-逆轉(zhuǎn)錄病毒載體轉(zhuǎn)導(dǎo)的基因修飾細(xì)胞zhiliao的受試者中發(fā)生白血病。因此,對(duì)于存在此類(lèi)風(fēng)險(xiǎn)的產(chǎn)品,有必要進(jìn)行長(zhǎng)期隨訪(fǎng)臨床研究以評(píng)估出現(xiàn)遲發(fā)不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)。溫州基因編輯脫靶檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)脫靶效應(yīng)比較好的方法:CIRCLE-seq。

深圳種子脫靶檢測(cè)評(píng)估標(biāo)準(zhǔn),脫靶檢測(cè)

檢測(cè)方法的敏感度、特異性和可重復(fù)性應(yīng)經(jīng)過(guò)驗(yàn)證,并設(shè)計(jì)適當(dāng)?shù)年?yáng)性和陰性對(duì)照;當(dāng)體內(nèi)靶細(xì)胞或替代細(xì)胞中載體序列陽(yáng)性的比例超出預(yù)期范圍時(shí),應(yīng)開(kāi)展克隆性生長(zhǎng)的評(píng)估。如果存在優(yōu)勢(shì)克隆或單克隆生長(zhǎng),應(yīng)在不超過(guò)3個(gè)月的時(shí)間內(nèi)再次檢測(cè)確認(rèn),并盡快開(kāi)展整合位點(diǎn)的分析。當(dāng)載體的整合位點(diǎn)確定后,應(yīng)與人類(lèi)基因組數(shù)據(jù)庫(kù)及基因組的其他數(shù)據(jù)庫(kù)等進(jìn)行比較,確定整合位點(diǎn)的基因功能,評(píng)估是否與包括zheng在內(nèi)的任何疾病有關(guān)。如果受試者體內(nèi)出現(xiàn)載體陽(yáng)性細(xì)胞的克隆性生長(zhǎng),或檢測(cè)發(fā)現(xiàn)基因整合位點(diǎn)在基因或相關(guān)基因附近,應(yīng)縮短檢測(cè)間隔至不超過(guò)3個(gè)月并密切監(jiān)測(cè)惡性liu征兆,直至檢測(cè)不到基因zhiliao載體。

長(zhǎng)期表達(dá)。與其他產(chǎn)品相比,部分基因zhiliao產(chǎn)品的明顯特征是可以在患者靶細(xì)胞或基因修飾細(xì)胞中持續(xù)存在并編碼表達(dá)作用因子(功能性蛋白或基因表達(dá)調(diào)節(jié)元件),并通過(guò)長(zhǎng)久或長(zhǎng)期改變靶細(xì)胞或組織的功能來(lái)達(dá)到zhiliao效果。同時(shí),由于基因zhiliao編碼的作用因子在體內(nèi)的長(zhǎng)期暴露或表達(dá)異常,可能產(chǎn)生與其功能相關(guān)的長(zhǎng)期安全性風(fēng)險(xiǎn),如細(xì)胞生長(zhǎng)失控和惡性liu形成、自身免疫反應(yīng)或其他無(wú)法預(yù)測(cè)的遲發(fā)性不良反應(yīng)。潛伏再jihuo。部分病毒類(lèi)基因zhiliao產(chǎn)品可能存在從潛伏期被再jihuo的可能性或者引起機(jī)體中已有病毒ganran的再jihuo,存在ganran相關(guān)的遲發(fā)性不良反應(yīng)的風(fēng)險(xiǎn)。影響CRISPR靶向性效率和特異性的因素有哪些?

深圳種子脫靶檢測(cè)評(píng)估標(biāo)準(zhǔn),脫靶檢測(cè)

如果基因zhiliao產(chǎn)品通過(guò)全身給xingfang式遞送,長(zhǎng)期隨訪(fǎng)中的安全性監(jiān)測(cè)不僅包括靶qiguan或靶組織的脫靶活性,而且還應(yīng)包括可能發(fā)生在其他組織和qiguan中的脫靶活性?;蚪M整合性或者脫靶活性的分析通常需采用有創(chuàng)性12檢測(cè)方法取得樣本,實(shí)施時(shí)還需要考慮技術(shù)和倫理上的可行性,例如靶向視網(wǎng)膜或肝臟等組織的基因zhiliao產(chǎn)品,可能難以對(duì)靶細(xì)胞采樣,這種情況下可能需要通過(guò)密切的臨床隨訪(fǎng)等方式間接評(píng)估風(fēng)險(xiǎn);同時(shí),選擇易于采樣的替代細(xì)胞也可能提供關(guān)于相關(guān)信息,例如靶向骨髓造血干細(xì)胞的基因zhiliao產(chǎn)品,可以通過(guò)采集外周血細(xì)胞或富集外周血干細(xì)胞進(jìn)行觀(guān)察。脫靶檢測(cè)guide-sequence,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專(zhuān)業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。浙江脫靶檢測(cè)企業(yè)

脫靶檢測(cè)CRO,推薦唯可生物,實(shí)驗(yàn)實(shí)力強(qiáng),專(zhuān)業(yè)性高,檢測(cè)效率高,結(jié)果準(zhǔn)確率高。深圳種子脫靶檢測(cè)評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)

降低CRISPR脫靶效應(yīng),你可以做什么?CRISPR技術(shù)是一種簡(jiǎn)單而強(qiáng)大的編輯基因組的工具。它使研究人員能夠輕松地改變DNA序列并修改基因功能。它的許多潛在應(yīng)用包括糾正遺傳缺陷,zhiliao和預(yù)防疾病的傳播,以及改善農(nóng)作物。在流行的用法中,CRISPR是CRISPR-Cas9的簡(jiǎn)寫(xiě)。CRISPRs是“有規(guī)律地間隔的短回文重復(fù)序列”的縮寫(xiě)。它是DNA的一個(gè)特殊區(qū)域,有兩個(gè)明顯的特征:存在核苷酸重復(fù)和間隔物。核苷酸的重復(fù)序列分布在整個(gè)CRISPR區(qū)域。間隔物是穿插在這些重復(fù)序列中的DNa pian段。深圳種子脫靶檢測(cè)評(píng)估標(biāo)準(zhǔn)