濟南亞硝基化修飾蛋白質組學服務

來源: 發(fā)布時間:2022-05-13

泛素化修飾PRM定量驗證:原理: 泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導了真核生物體內80%~85%的蛋白質降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質的活性和定位,調控包括細胞周期、細胞凋亡、轉錄調控、DNA 損傷修復以及免疫應答等在內的多種細胞活動。首先對泛素化的蛋白進行胰酶消化,在賴氨酸的修飾位點上會產生兩個甘氨酸的殘基(K-GG),利用對泛素化賴氨酸(K-GG)具有高親和力的基序抗體,特異性富集復雜樣本中的泛素化肽段,結合LC-MS/MS蛋白質定量方法,實現(xiàn)大規(guī)模泛素化蛋白質定性定量分析。蛋白翻譯后修飾方式的鑒定過程中,蛋白會首先被酶切成肽段,然后進入質譜進行分析。濟南亞硝基化修飾蛋白質組學服務

乙?;揎椀鞍捉M學應用方向有什么?1、基礎醫(yī)學、臨床診斷:生物標志物,疾病機理機制,疾病分型,個性化治理等;2、生物醫(yī)藥:藥物作用機理,藥效評價,藥物開發(fā)等;3、微生物領域:致病機理,耐藥機制,病原體-宿主相互作用研究等;4、海洋水產:漁業(yè)資源,海水養(yǎng)殖,漁業(yè)環(huán)境與水產品安全等;5、生物能源、環(huán)境科學領域:發(fā)酵過程優(yōu)化,生物燃料生產,環(huán)境危定風險評估研究等;6、食品營養(yǎng):食品儲藏及加工條件優(yōu)化,食品組分及品質鑒定,功能性食品開發(fā),食品安全監(jiān)檢測等。浙江泛素化修飾蛋白質組學蛋白質翻譯后修飾是指蛋白質在翻譯中或翻譯后經歷的一個共價加工過程。

翻譯后修飾蛋白組分析:蛋白質翻譯后修飾(PTMs)是指蛋白質在翻譯中或翻譯后的化學修飾過程。蛋白質翻譯后修飾(PTMs)通過給蛋白質添加磷酸酯、乙酸酯、酰胺基或甲基等官能團增加蛋白質組的功能多樣性,并影響正常細胞生物學和發(fā)病機理的幾乎所有方面。蛋白質翻譯后修飾在許多細胞過程中起著關鍵作用,如細胞分化、蛋白質降解、信號傳導和調節(jié)過程、基因表達調節(jié)以及蛋白質相互作用。蛋白質翻譯后修飾PTMs通常包括磷酸化、糖基化、泛素化、亞硝基化、甲基化、乙?;?、脂質化和蛋白水解。因此,PTM的特征(包括修飾類別和修飾位點)在細胞生物學以及疾病診斷和預防研究中至關重要。

蛋白質翻譯后修飾分析策略:早期蛋白質組研究的大部分工作集中在細胞生長的不同時期,或疾病或有絲分裂原刺激后的蛋白質表達水平的變化。然而,許多生命過程不僅受蛋白質的相對豐度控制,還受時空分布可逆的翻譯后修飾控制。因此,揭示翻譯后修飾的規(guī)律是了解蛋白質復雜性和多樣的生物學功能的前提。蛋白質的翻譯后修飾是一個復雜的過程。目前,發(fā)現(xiàn)的比較常見的修飾類型是糖基化、泛素化和磷酸化。樣品中翻譯后修飾蛋白質含量低、動態(tài)范圍廣給相關研究帶來了很大的挑戰(zhàn)?;诜g后修飾蛋白的異質性和相對豐度低的特點,主要利用凝膠、生物質譜和生物信息學工具對其進行研究。用于PTM分析的質譜方法類似于用于“常規(guī)”蛋白質鑒定的方法,包括自下而上、自中而下和自上而下的蛋白質組學分析。蛋白質翻譯后修飾有什么生物學意義?

蛋白質翻譯后修飾自中而下分析策略:自中而下的蛋白質組學技術可用于組蛋白修飾的分析。樣品制備與普遍使用的自下而上的分析策略相同,直到得到純化的組蛋白。提取組蛋白后,用GluC進行消化。然后用弱陽離子交換/親水相互作用色譜(WCX-HILIC)與配備電子轉移解離(ETD)的高分辨率質譜聯(lián)機聯(lián)用,對樣品進行理想的分離。譜識別可以用傳統(tǒng)的軟件進行,但是由于估計適當?shù)腻e誤發(fā)現(xiàn)率的問題,需要對結果進行過濾。自上而下分析策略:自上而下的技術可以直接引入完整的蛋白質并在串聯(lián)質譜儀上對其進行片段化,不需要蛋白質水解消化。目前,有兩種完全分離蛋白質的方法:離線和在線。前者用四維分離法,后者用WCX-HILIC。蛋白質翻譯后修飾組學磷酸化修飾具有簡單的特性。南京蛋白質泛素化修飾組學領域

目前,發(fā)現(xiàn)的比較常見的修飾類型是糖基化、泛素化和磷酸化。濟南亞硝基化修飾蛋白質組學服務

蛋白質翻譯后修飾介紹:蛋白質翻譯后修飾(PTMs)是指蛋白質在翻譯中或翻譯后的化學修飾過程。蛋白質翻譯后修飾(PTMs)通過給蛋白質添加磷酸酯,乙酸酯,酰胺基或甲基等官能團增加蛋白質組的功能多樣性,并影響正常細胞生物學和發(fā)病機理的幾乎所有方面。蛋白質翻譯后修飾在許多細胞過程中起著關鍵作用,如細胞分化、蛋白質降解、信號傳導和調節(jié)過程、基因表達調節(jié)以及蛋白質相互作用。蛋白質翻譯后修飾PTMs通常包括磷酸化,糖基化,泛素化,亞硝基化,甲基化,乙?;|化和蛋白水解。因此,PTM的特征(包括修飾類別和修飾位點)在細胞生物學以及疾病診斷和預防研究中至關重要。濟南亞硝基化修飾蛋白質組學服務