蛋白質(zhì)翻譯后修飾在蛋白質(zhì)中磷酸化位點分析時應(yīng)該注意些什么問題?覆蓋率:覆蓋率越高,檢測和鑒定含有修飾基團的肽幾率就越大。修飾位點的占有率:被修飾的蛋白質(zhì)的百分比低,則檢測到修飾肽的機會會隨之減少。如果百分比較高(> 30%),則有助于識別修飾位點。棕櫚?;鞍仔揎椯|(zhì)譜鑒定方法:S-棕櫚?;闹饕δ苁谴龠M蛋白質(zhì)與細胞膜的結(jié)合。蛋白質(zhì)可以由一個棕櫚?;M成,也可以與更多棕櫚基或與其他脂質(zhì),如豆蔻酰基。由于對S-棕櫚?;鞍追治鋈匀痪哂刑魬?zhàn)性,由于S-棕櫚酰化修飾蛋白亞水平以及疏水性和潛在不穩(wěn)定的硫代質(zhì)鏈的S-脂?;摹T诩毎?,乙酰化修飾的反應(yīng)由乙?;D(zhuǎn)移酶所催化,將乙酰輔酶A的乙?;D(zhuǎn)移并添加在蛋白質(zhì)賴氨酸殘基上。南京亞硝基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析價格
乙酰化修飾蛋白組學(xué)應(yīng)用方向:1、乙?;揎椗c細胞基因表達調(diào)控、表觀調(diào)控、細胞凋亡、細胞代謝、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)、蛋白質(zhì)穩(wěn)定性等生理過程研究。2、乙?;鸬拇x疾病、代謝紊亂發(fā)生等疾病機理研究。乙?;飳W(xué)意義:1、調(diào)節(jié)DNA-蛋白、蛋白-蛋白相互作用;2、與其他PTMs發(fā)生crosstalk;3、調(diào)節(jié)酶活性;4、調(diào)控蛋白亞細胞定位。生物領(lǐng)域各個研究方面,如:1、農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機制,生長發(fā)育機制,育種保護研究等;2、 畜牧業(yè):肉類及乳品質(zhì)研究,致病機理研究等。四川蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)主要技術(shù)蛋白質(zhì)翻譯后修飾 (PTMs) 進一步促進了從基因組水平到蛋白質(zhì)組復(fù)雜性的增加。
泛素化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)原理:盡管質(zhì)譜儀器的分析能力近年來有了長足的發(fā)展,但是由于蛋白翻譯后修飾化學(xué)計量值低、復(fù)雜性大,直接將蛋白組(如全細胞裂解產(chǎn)物,組織勻漿產(chǎn)物或全血清蛋白)的酶解肽段送入質(zhì)譜鑒定和定量PTM是非常困難的。因此,很多翻譯后修飾的富集方法會被采用,來提高樣品中PTM肽段的豐度和相對比例,從而提高了質(zhì)譜對翻譯后修飾位點的鑒定效率。研究發(fā)現(xiàn)在泛素化修飾的蛋白在tyrpsin的作用下都會產(chǎn)生diGly位點?;谶@一特異性,利用針對蛋白質(zhì)翻譯后修飾(PTM)基序(motif)抗體,在肽段水平上免疫親和富集帶有泛素化修飾的肽段,利用液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜(LC-MS/MS)進行定量分析,能夠快速、準確、高通量地分析多種疾病相關(guān)信號通路關(guān)鍵節(jié)點蛋白修飾的變化,滿足創(chuàng)新性研究、生物標志物鑒定、藥物靶點篩選和評價的需求。
蛋白質(zhì)翻譯后修飾分析策略:早期蛋白質(zhì)組研究的大部分工作集中在細胞生長的不同時期,或疾病或有絲分裂原刺激后的蛋白質(zhì)表達水平的變化。然而,許多生命過程不僅受蛋白質(zhì)的相對豐度控制,還受時空分布可逆的翻譯后修飾控制。因此,揭示翻譯后修飾的規(guī)律是了解蛋白質(zhì)復(fù)雜性和多樣的生物學(xué)功能的前提。蛋白質(zhì)的翻譯后修飾是一個復(fù)雜的過程。目前,發(fā)現(xiàn)的比較常見的修飾類型是糖基化、泛素化和磷酸化。樣品中翻譯后修飾蛋白質(zhì)含量低、動態(tài)范圍廣給相關(guān)研究帶來了很大的挑戰(zhàn)。基于翻譯后修飾蛋白的異質(zhì)性和相對豐度低的特點,主要利用凝膠、生物質(zhì)譜和生物信息學(xué)工具對其進行研究。用于PTM分析的質(zhì)譜方法類似于用于“常規(guī)”蛋白質(zhì)鑒定的方法,包括自下而上、自中而下和自上而下的蛋白質(zhì)組學(xué)分析。泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位。
甲基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù)應(yīng)用領(lǐng)域:基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)、臨床診斷:生物標志物,疾病機理機制,疾病分型,個性化治理等;生物醫(yī)藥:藥物作用機理,藥效評價,藥物開發(fā)等;農(nóng)林領(lǐng)域:抗逆脅迫機制,生長發(fā)育機制,育種保護研究等;畜牧業(yè):肉類及乳品質(zhì)研究,致病機理研究等;微生物領(lǐng)域:致病機理,耐藥機制,病原體-宿主相互作用研究等;海洋水產(chǎn):漁業(yè)資源,海水養(yǎng)殖,漁業(yè)環(huán)境與水產(chǎn)品安全等。技術(shù)優(yōu)勢:采用抗體,特異性高;鑒定通量高, 一次可檢測高可達上千個甲基化修飾位點。蛋白質(zhì)修飾位點能夠影響蛋白的多種屬性,包括蛋白質(zhì)折疊、活性以及之后的功能。四川蛋白質(zhì)糖基化修飾組學(xué)主要技術(shù)
蛋白質(zhì)翻譯后修飾是指蛋白質(zhì)在翻譯中或翻譯后經(jīng)歷的一個共價加工過程。南京亞硝基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析價格
蛋白質(zhì)乙酰化修飾組學(xué):乙?;揎検侵冈诿富蚍敲缸饔孟拢瑢⒁阴oA的乙?;鶊F轉(zhuǎn)移至蛋白質(zhì)氨基酸的殘基上。蛋白質(zhì)乙?;彩且环N可逆的酶促反應(yīng)過程。乙?;D(zhuǎn)移酶可以將乙酰基團(CH3C=O)從乙酰輔酶A轉(zhuǎn)移至蛋白質(zhì)。同理,去乙酰化酶則可以逆轉(zhuǎn)這種反應(yīng)。蛋白質(zhì)上的賴氨酸乙?;羌毎麅?nèi)一種重要的PTMs過程。不僅發(fā)生在細胞核內(nèi)組蛋白、轉(zhuǎn)錄因子等上,在細胞質(zhì)和線粒體中也存在著諸多蛋白的乙?;揎棥T谥参镅芯款I(lǐng)域內(nèi),乙?;揎椫饕獏⑴c植物光合作用、生長發(fā)育、脅迫響應(yīng)等過程。在醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,乙酰化修飾可調(diào)節(jié)人體內(nèi)某種代謝酶,控制糖尿病,這一發(fā)現(xiàn)為糖尿病干預(yù)與療理帶來新的希望。南京亞硝基化修飾蛋白質(zhì)組學(xué)分析價格