湖北琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)組學研究

來源: 發(fā)布時間:2022-03-27

蛋白質(zhì)乙?;揎椀墓δ埽耗壳皩σ阴;揎椀墓δ苎芯恐饕性趯毎D(zhuǎn)錄調(diào)控,以及對代謝通路的調(diào)控這兩個方面。在眾多乙?;揎椀牡鞍踪|(zhì)中,研究較多的要數(shù)細胞核中包圍DNA的組蛋白了。組蛋白和DNA纏繞構(gòu)成核小體,組蛋白的甲基化、乙?;揎椖軌蛘{(diào)節(jié)DNA纏繞的松緊度,從而對基因表達進行調(diào)控,因此,組蛋白的翻譯后修飾是表觀遺傳學研究中的重要一環(huán)。另外,研究也發(fā)現(xiàn)乙?;揎椘毡榇嬖谟谌说亩喾N代謝酶之中,并且參與調(diào)控代謝通路以及代謝酶的活性。其中在肝臟這樣的代謝中就存在著多種代謝酶被高度乙酰化。泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。湖北琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)組學研究

翻譯后修飾蛋白組學分析:在蛋白翻譯后修飾方式的鑒定過程中,蛋白會首先被酶切成肽段,然后進入質(zhì)譜進行分析。通過質(zhì)譜分析,得到的是一系列肽段的分子質(zhì)量信息。對于某一個特定肽段而言,在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下,其序列信息和分子量是確定的。當它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后,例如磷酸化修飾,由于序列信息和分子量是確定的,磷酸根的分子量也是確定的。在質(zhì)譜檢測過程中發(fā)現(xiàn)其中的部分肽段的分子量剛好增加了一個磷酸根的分子量,假設(shè)這個肽段就發(fā)生了磷酸化修飾,再通過二級質(zhì)譜圖進行二次確認。哈爾濱蛋白質(zhì)亞硝基化修飾組學類型蛋白質(zhì)翻譯后修飾有什么生物學意義?

蛋白質(zhì)乙?;揎椊M學技術(shù):乙酰化修飾是體內(nèi)高度保守的可逆轉(zhuǎn)的蛋白修飾,對細胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子的刺激有著非常重要的作用。此外,還存在大量的非組蛋白乙?;揎梾⑴c了代謝通路及代謝酶活性的調(diào)節(jié)。乙?;揎椊M學技術(shù)服務(wù)采用肽段預分離降低高豐度組蛋白對蛋白乙酰化鑒定的影響,再結(jié)合免疫共沉淀通過高效的抗體富集乙?;碾亩?,從而實現(xiàn)大規(guī)模乙?;蔫b定及定量。蛋白質(zhì)泛素化修飾組學技術(shù):泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外,泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位,調(diào)控包括細胞周期、細胞凋亡、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、DNA 損傷修復以及免疫應(yīng)答等在內(nèi)的多種細胞活動。

蛋白質(zhì)磷酸化修飾組學技術(shù)優(yōu)點:1、全方面性:磷酸化蛋白質(zhì)組學以整個細胞蛋白為研究對象,研究內(nèi)容包括了細胞內(nèi)具有生命功能的蛋白,如細胞增生、細胞分裂和細胞分化等相關(guān)蛋白,因而研究更為全方面。2、可靠性:傳統(tǒng)的生物學研究蛋白質(zhì)磷酸化往往針對特定條件,以兩個蛋白或更多蛋白之間的相互作用為出發(fā)點,具有局限性,缺乏整體認識。磷酸化蛋白質(zhì)組學則可檢測不同蛋白激酶及磷酸化酶對同一個蛋白磷酸化程度的影響,因而結(jié)果具有普遍性和可靠性。3、有效性:磷酸化蛋白質(zhì)組學反映的是細胞內(nèi)真實發(fā)生的事件,在一次試驗中考慮了不同變量,克服了生物學中逐步添加變量的缺陷。4、探索性:磷酸化蛋白質(zhì)組學以細胞內(nèi)蛋白為研究對象,相對于傳統(tǒng)的生物學研究以及蛋白質(zhì)芯片,更易發(fā)現(xiàn)未知的新磷酸化位點和磷酸化蛋白質(zhì)。如果可以聯(lián)合生物學技術(shù),則可以發(fā)現(xiàn)具有磷酸化或者去磷酸化功能的酶。在早期的研究中,乙酰化修飾一直被認為是真核細胞所特有的一種翻譯后修飾。

質(zhì)譜分析蛋白翻譯后修飾原理:相較于沒有發(fā)生翻譯后修飾的蛋白,翻譯后修飾蛋白會在特定肽段序列有分子量的增加。在蛋白翻譯后修飾方式的質(zhì)譜分析過程中,蛋白會首先被酶切成肽段,然后進入質(zhì)譜進行分析;通過質(zhì)譜分析,得到的是一系列肽段的相對分子質(zhì)量信息。對于某一個特定的肽段而言,在沒有發(fā)生任何翻譯后修飾的情況下其序列信息和分子量是確定的,當它發(fā)生了某種翻譯后修飾之后,例如磷酸化修飾,因為磷酸根的分子量也是確定的,所以在質(zhì)譜檢測過程中如果發(fā)現(xiàn)部分肽段的分子量剛好增加了一個磷酸根的分子量,則可以假設(shè)這個肽段發(fā)生了磷酸化修飾,再通過二級或多級質(zhì)譜的譜圖進行二次確認即可實現(xiàn)翻譯后修飾類型鑒定及修飾位點分析等。目前對乙?;揎椀墓δ苎芯恐饕性趯毎D(zhuǎn)錄調(diào)控,以及對代謝通路的調(diào)控這兩個方面。深圳蛋白質(zhì)翻譯后修飾組學方法

蛋白質(zhì)糖基化是一種常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾。湖北琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)組學研究

蛋白質(zhì)磷酸化修飾類型:根據(jù)磷酸氨基酸殘基的不同,可將磷酸化蛋白質(zhì)分為4類,即O-磷酸鹽蛋白質(zhì)、N-磷酸鹽蛋白質(zhì)、?;姿猁}蛋白質(zhì)和S-磷酸鹽蛋白質(zhì)。1、O-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過羥氨基酸(如絲氨酸、蘇氨酸或酪氨酸)的磷酸化形成。2、 N-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過精氨酸、賴氨酸或組氨酸的磷酸化形成。3、 ?;姿猁}蛋白質(zhì)通過天冬氨酸或谷氨酸的磷酸化形成。4、 S-磷酸鹽蛋白質(zhì)通過半胱氨酸磷酸化形成。蛋白質(zhì)磷酸化修飾鑒定方法:免疫印跡技術(shù)是在凝膠電泳和固相免疫測定技術(shù)基礎(chǔ)上發(fā)展起來的、根據(jù)特定抗原-抗體的特異性反應(yīng)來檢測復雜樣品中的某種蛋白質(zhì)的免疫生化分析方法。湖北琥珀?;揎椀鞍踪|(zhì)組學研究

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