蛋白磷酸化檢測方法：一、Western Blot檢測方法優(yōu)勢：1. WB方法簡便，多數(shù)實驗室具備Western Blot設備條件。2. 許多磷酸化抗體十分靈敏，能夠檢測低至10ug的蛋白樣品。3. 對于豐度低的蛋白，可以先通過IP使用目標蛋白的抗體對目標蛋白進行富集，再進行WB檢測被磷酸化的蛋白，檢測效率可以提高幾倍甚至幾十倍。二、質(zhì)譜檢測方法：Western Blot的方法雖然簡便，但是對于大規(guī)模分析復雜的生物樣品的磷酸化水平就不再適用了。而質(zhì)譜卻能很好的解決這一問題。依靠高準確度質(zhì)譜儀，如今快速準確分析細胞中高豐度蛋白的磷酸化修飾已是非常簡單的事。具體的檢測方法為先通過SDS-PAGE膠，或者2D-PAGE膠等分離目標蛋白，將含有目標蛋白的條帶切下，胰酶消化，LC-MS/MS檢測分析蛋白序列和相應位點的磷酸化修飾。這個方法適用于同時檢測多個目標蛋白的磷酸化水平。蛋白磷酸化修飾過程是通過蛋白激酶催化，將磷酸基團從ATP轉移到多肽底物的絲氨酸、或酪氨酸殘基上。杭州丙?；揎椀鞍踪|(zhì)組學分析研究
蛋白質(zhì)學組翻譯后修飾自下而上分析策略：常用的糖蛋白分離和富集技術有：a. 凝集素親和技術；b. 肼化學富集；c. 親水性相互作用色譜法；d. β-消除/邁克爾加成反應?；谫|(zhì)譜的糖蛋白鑒定和糖基化位點測定方法有：a. PNGase F酶法；b. Endo H酶法；c. 三氟甲烷磺酸(TFMS)法。泛素化：泛素是一種由76個氨基酸組成的多肽，在真核生物中高度保守，可通過異肽鍵與目標蛋白賴氨酸殘基的氨基進行共價連接。泛素化蛋白的富集主要基于標記，泛素用親和標簽（通常為6xHis）進行標記，并通過鎳螯合色譜親和提取泛素化蛋白。由于泛素的C端為Arg-Gly-Gly結構，經(jīng)胰蛋白酶水解后，Gly-Gly保留在修飾蛋白的肽鏈上，使肽的質(zhì)量增加114，因此可作為泛素定位位點的質(zhì)量標記。用HPLC對樣品進行預分離，使用針對特定殘留結構的抗體富集泛素化肽，可很大程度上提高泛素化蛋白的濃度。串聯(lián)質(zhì)譜可以鑒定泛素化位點。江蘇亞硝基化修飾蛋白質(zhì)組學價錢乙?；揎検求w內(nèi)保守的可逆轉的蛋白修飾。
蛋白質(zhì)翻譯后修飾：蛋白質(zhì)的翻譯后修飾通過可逆的共價鍵將小分子或蛋白質(zhì)與底物蛋白質(zhì)上特定的氨基酸結合，調(diào)控著底物的酶活性、功能以及三級結構的變化。各種蛋白質(zhì)翻譯后修飾在信號通路和網(wǎng)絡中發(fā)揮著重要的作用，翻譯后修飾系統(tǒng)的紊亂將導致一系列疾病的發(fā)生。通過實驗的方法鑒定蛋白質(zhì)翻譯后修飾的位點需要耗費大量的資金和時間，并且酶反應的優(yōu)化常常難以實現(xiàn)。而計算的方法則能夠快速、準確的預測酶特異性的底物蛋白質(zhì)及其修飾位點。
蛋白磷酸化修飾過程：蛋白磷酸化修飾這一過程是通過蛋白激酶催化，將磷酸基團從ATP轉移到多肽底物的絲氨酸、蘇氨酸，或酪氨酸殘基上。并且磷酸化修飾的過程是可逆的，去磷酸化反應由蛋白磷酸酶催化完成。蛋白磷酸化檢測方法：Western Blot檢測方法：Western Blot是檢測蛋白磷酸化水平的常用方法，主要過程為先利用SDS-PAGE分離蛋白質(zhì)，隨后將蛋白質(zhì)轉移到PVDF膜上，然后使用特異性識別磷酸化蛋白的抗體來鑒定目標蛋白的磷酸化水平。只有被磷酸化修飾的蛋白才會在相應分子質(zhì)量的地方顯現(xiàn)特異性蛋白條帶。蛋白質(zhì)翻譯后修飾的作用主要是改變蛋白質(zhì)的功能。
蛋白質(zhì)翻譯后修飾有什么生物學意義？可以使蛋白質(zhì)具有生物活性，可以發(fā)揮相應的功能。翻譯是蛋白質(zhì)生物合成（基因表達中的一部分，基因表達還包括轉錄）過程中的第二步（轉錄為第1步），翻譯是根據(jù)遺傳密碼的中心法則，將成熟的信使RNA分子（由DNA通過轉錄而生成）中“堿基的排列順序”（核苷酸序列）解碼，并生成對應的特定氨基酸序列的過程。但也有許多轉錄生成的RNA，如轉運RNA（tRNA）、核糖體RNA（rRNA）和小核RNA（snRNA）等并不被翻譯為氨基酸序列。蛋白質(zhì)翻譯后修飾是指對翻譯后的蛋白質(zhì)進行共價加工的過程。浙江棕櫚?；揎椀鞍踪|(zhì)組學研究
蛋白質(zhì)糖基化是一種常見的蛋白質(zhì)翻譯后修飾。杭州丙?；揎椀鞍踪|(zhì)組學分析研究
蛋白質(zhì)泛素化修飾組學技術：泛素化修飾是一種重要的翻譯后修飾。泛素-蛋白酶體系統(tǒng)介導了真核生物體內(nèi)80%~85%的蛋白質(zhì)降解。此外，泛素化修飾還可以直接影響蛋白質(zhì)的活性和定位，調(diào)控包括細胞周期、細胞凋亡、轉錄調(diào)控、DNA 損傷修復以及免疫應答等在內(nèi)的多種細胞活動。樣品要求：1、SDS-PAGE條帶：5個以上可見考染條帶。2、溶液（目標蛋白質(zhì)）：目標蛋白總量>50μg，目標蛋白濃度>80%。3、溶液（大規(guī)?；旌系鞍踪|(zhì)）：蛋白總量>1mg，蛋白濃度>1μg/μl。杭州丙?；揎椀鞍踪|(zhì)組學分析研究
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