代謝組學(xué)疾病診斷應(yīng)用:與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比, 代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性,是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律,目前據(jù)此目標(biāo)相距甚遠(yuǎn)。盡管充滿了挑戰(zhàn),研究人員仍然堅(jiān)信,與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。疾病導(dǎo)致機(jī)體病理生理過程變化,引起代謝產(chǎn)物發(fā)生相應(yīng)的改變,通過對某些代謝產(chǎn)物進(jìn)行分析,并與 正常人的代謝產(chǎn)物比較,尋找疾病的生物標(biāo)記物,將提供一種較好的疾病診斷方法。靶向代謝組學(xué)(Trgeted metabolomics)則為目標(biāo)性代謝組學(xué)。哈爾濱植物靶向代謝組學(xué)定性分析
代謝組學(xué)的研究對象與層次有哪些?一般來說,代謝組學(xué)關(guān)注的對象是分子量在1000以下的小分子化合物。根據(jù)研究的對象和目的不同,科學(xué)家將生物體系的代謝產(chǎn)物分析分為4個層次:代謝物靶標(biāo)分析:某一個或幾個特定組分的定性和定量分析,如某一類結(jié)構(gòu)、性質(zhì)相關(guān)的化合物(氨基酸、有機(jī)酸、順二醇類)或者某一代謝途徑的所有中間產(chǎn)物或多條代謝途徑的標(biāo)志性組分。代謝物指紋分析:同時對多個代謝物進(jìn)行分析,不分離鑒定具體單一組分。代謝輪廓分析:限定條件下對生物體內(nèi)特定組織內(nèi)的代謝產(chǎn)物的快速定性和半定量分析。代謝組分析:對生物體或體內(nèi)某一特定組織所包含的所有代謝物的定量分析,并研究該代謝物組在外界干預(yù)或病理生理?xiàng)l件下的動態(tài)變化規(guī)律。北京GC-MS非靶向代謝組學(xué)服務(wù)代謝組學(xué)是要涉及研究每一個代謝組分的共性、特性和規(guī)律。
選擇代謝組學(xué)作為科研技術(shù)手段的優(yōu)勢有哪些?代謝組學(xué)的研究處于生物信息流的中游,介于基因、蛋白質(zhì)和細(xì)胞、組織之間,在生物信息的傳遞中起到承上啟下的作用。小分子的產(chǎn)生和代謝是基因表達(dá)的下游產(chǎn)物,生物體液的代謝產(chǎn)物分析能夠更直接,更準(zhǔn)確的反映生物體的病理生理狀態(tài)。代謝物的種類少,大約在103個數(shù)量級,要遠(yuǎn)小于基因和蛋白質(zhì)的數(shù)據(jù),物質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)要簡單得多,分析起來更簡單明了。代謝組學(xué)的代謝物信息庫簡單,它遠(yuǎn)沒有全基因組測序及大量表達(dá)序列標(biāo)簽的數(shù)據(jù)庫那么復(fù)雜?;蚝偷鞍踪|(zhì)表達(dá)的有效微小變化會在代謝物上得到放大,從而使檢測更容易。代謝產(chǎn)物在各個生物體系中都是類似的,所以代謝組學(xué)研究中采用的技術(shù)更容易在各個領(lǐng)域中通用,也更容易被人接受。
代謝組學(xué)應(yīng)用方向:腸道菌群代謝組學(xué),運(yùn)用代謝組學(xué)檢測腸菌代謝物的動態(tài)變化,了解腸道菌群在宿主中的代謝狀態(tài),直觀的研究腸道菌群與疾病發(fā)生的發(fā)展的關(guān)系,為疾病的預(yù)防,調(diào)高宿主的健康水平提供新的思路。經(jīng)典脂質(zhì)組學(xué):對生物體、組織或細(xì)胞中的脂質(zhì)以及與其相互作用的分子進(jìn)行全方面系統(tǒng)的鑒定分析。了解脂質(zhì)的結(jié)構(gòu)和功能,揭示脂質(zhì)代謝與細(xì)胞乃至機(jī)體的生理、病理過程之間的關(guān)系,普遍運(yùn)用于分子生理學(xué)、功能基因組學(xué)以及環(huán)境與健康等重要領(lǐng)域。與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比, 代謝組學(xué)的研究側(cè)重于相關(guān)特定組分的共性。
靶向代謝組學(xué)分析成功的關(guān)鍵因素是準(zhǔn)確度、高通量和可靠性。靶向代謝組學(xué)鑒定一般采用 GC/MS 系統(tǒng)的選擇性離子監(jiān)測 (SIM),或在三重串聯(lián)四極桿 LC/MS 系統(tǒng)上用多反應(yīng)離子監(jiān)測 (MRM) 進(jìn)行靶向 MS/MS。SIM 比全掃描圖譜采集具有更高的靈敏度,在單四極桿質(zhì)譜中,這種靈敏度增強(qiáng)的原因是延長了所選擇離子的采集時間。因?yàn)楸O(jiān)測的是一個很小的質(zhì)量窗口,所以質(zhì)量色譜圖只表示對極為特定質(zhì)量的檢測。在大多數(shù)情況下,靈敏度可以提高 10 倍。MRM 是進(jìn)行質(zhì)譜定量的選擇方法,與 SIM 相比更為靈敏、更加特異??梢援a(chǎn)生獨(dú)特的碎片離子,可對非常復(fù)雜基質(zhì)中的目標(biāo)化合物進(jìn)行監(jiān)測和定量。代謝組學(xué)主要研究的是各種代謝路徑的底物。廣州個性化定制靶向代謝組學(xué)鑒定
與基因組學(xué)和蛋白質(zhì)組學(xué)相比,代謝組學(xué)與生理學(xué)的聯(lián)系更加緊密。哈爾濱植物靶向代謝組學(xué)定性分析
代謝組學(xué)什么類型的樣本更適合,樣本采集需要注意什么?絕大多數(shù)可以可靠收集的生物樣本都適用于代謝組學(xué)研究。常見的樣本主要有:臨床和動物的血清、血漿、尿液、糞便、各類組織、體液;細(xì)胞和微生物、培養(yǎng)液和發(fā)酵液;植物的根、莖、葉、花等。代謝每時每刻都在發(fā)生變化,我們需要研究的是某個或多個瞬時狀態(tài),因此樣本采集一般需要保證“快速、一致、簡單”的,采集后通過低溫淬滅(如液氮淬滅或低溫凍存等)的方法阻止離體后的樣本的代謝活動。另外,不同的檢測要求也需要配合不同的收集方法,具體步驟請參照譜領(lǐng)生物樣本收集步驟文件。哈爾濱植物靶向代謝組學(xué)定性分析
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