且研究表明HNRNPC通過(guò)m6A與RNA結(jié)合調(diào)控目標(biāo)轉(zhuǎn)錄本的豐度和選擇性剪切[9].圖1m6A修飾的酶系統(tǒng)[10]m6A生物學(xué)功能越來(lái)越多的證據(jù)表明m6A修飾在哺乳動(dòng)物中發(fā)揮重要的生物功能。例如,在轉(zhuǎn)錄水平上調(diào)控RNA的穩(wěn)定性[11]、定位[12]、運(yùn)輸、剪切[13]和翻譯[14]。ClaudioR.等發(fā)現(xiàn)依賴(lài)METTL3的pri-miRNA甲基化,會(huì)促進(jìn)DGCR8識(shí)別和加工,從而促進(jìn)microRNA的成熟[15]。此外,m6A識(shí)別蛋白HNRNPA2B1促進(jìn)pri-miRNA加工成pre-miRNA[16]。另外,環(huán)狀RNA上m6A的修飾能促進(jìn)環(huán)狀RNA的翻譯[17]。m6A修飾在基因表達(dá)調(diào)控中起著重要的作用,其調(diào)控機(jī)制的異??赡芘c人類(lèi)疾病或相關(guān)。目前發(fā)現(xiàn)m6A可能會(huì)影響精子發(fā)育(ALKBH5,METTL3,Ythdc2)、發(fā)育(METTL3、FTO、ALKBH5)、免疫(METTL3)、UV誘導(dǎo)的DNA損傷反應(yīng)(METTL3,F(xiàn)TO)、生成(YTHDF2)或轉(zhuǎn)移(METTL14)、干細(xì)胞更新(METTL14)、脂肪分化(FTO)、生物節(jié)律、細(xì)胞發(fā)育分化、細(xì)胞分裂及其它的一些生命過(guò)程。例如,ALKBH5敲除的雄性小鼠增加了mRNA中的m(6)A修飾,其特點(diǎn)是凋亡影響減數(shù)分裂中期的精子細(xì)胞,引起生育能力受損[7]。METTL3和METTL14增加弱精癥精子的m6A水平[18],在生殖細(xì)胞中,METTL3的敲除嚴(yán)重抑制精子分化和減數(shù)分裂的發(fā)生。RNA提取過(guò)程中試劑的作用是什么?寧夏小鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)
準(zhǔn)備碎冰和。把膜置于甲醇溶液中活化1分鐘,然后轉(zhuǎn)移至轉(zhuǎn)膜液中平衡3分鐘后備用。2、轉(zhuǎn)膜組裝轉(zhuǎn)膜三明治夾,這一步很關(guān)鍵,重要的是膠和膜之間不能有氣泡且膜與膠要保證貼合緊密(否則會(huì)翻車(chē)),可以加多點(diǎn)轉(zhuǎn)膜液泡著。組裝好后加滿轉(zhuǎn)膜液,設(shè)置電源參數(shù),我習(xí)慣恒流轉(zhuǎn)膜,200-280毫安,1-2小時(shí),根據(jù)分子量定,如50KD的分子用60分鐘就夠了。如果一個(gè)電源帶兩個(gè)轉(zhuǎn)膜大槽即四塊膠,我就會(huì)用恒壓70-110V。這個(gè)過(guò)程重要的是做好降溫。這里簡(jiǎn)單說(shuō)一下蛋白分子量與玻璃板厚度,分離膠的濃度,轉(zhuǎn)膜電源參數(shù)的選擇問(wèn)題。如果是能用1毫米的玻璃板就不用,因?yàn)檗D(zhuǎn)膜是在電場(chǎng)的作用下蛋白分子從膠上遷移到膜上,1毫米膠的蛋白遷移距離要比。選擇更薄的膠蛋白轉(zhuǎn)膜時(shí)間可以減少,從而減少發(fā)熱,以免膠變形,條帶也會(huì)更好看。然后是分離膠的濃度,如果是150—200KD的分子選10%以下的的分離膠,200—300KD的選8%的,300KD以上的選6%的,小于30KD的200mA30分鐘,30-100KD的按分子量的數(shù)值算,如70KD,250mA70分鐘;100-150KD的250mA100分鐘;150—300KD的分子轉(zhuǎn)膜條件用280毫安(以上均是對(duì)于,),120分鐘足矣,前提是膠的濃度相適應(yīng)。五、封閉孵一抗1、封閉轉(zhuǎn)膜結(jié)束后。河北動(dòng)物科研技術(shù)服務(wù)購(gòu)買(mǎi)此外,動(dòng)物模型的倫理問(wèn)題也不容忽視,科研人員需要在符合倫理規(guī)定的前提下進(jìn)行相關(guān)研究。
代謝組學(xué)的研究對(duì)象大都是相對(duì)分子量在1000以內(nèi)的小分子物質(zhì),因此常用的血液樣本在取樣后,應(yīng)小心操作,防止溶血,盡快分離出血清,分置于溫環(huán)境下保存。由于用于理實(shí)驗(yàn)的動(dòng)物采集相對(duì)其他樣品的采集,操作更繁瑣,在處理過(guò)程中許多細(xì)節(jié)容易忽略,造成數(shù)據(jù)不完美(甚至不能用)。因此接下來(lái)將重點(diǎn)介紹樣品采集的注意事項(xiàng)及其固定。樣品采集注意事項(xiàng)應(yīng)新鮮,操作時(shí)間盡可能短,否則細(xì)胞發(fā)生死后變化、自融及現(xiàn)象。是動(dòng)物心臟還在跳動(dòng)時(shí)采集,樣本取出后在5分鐘以內(nèi)置于固定液內(nèi),避免長(zhǎng)時(shí)間暴露在空氣環(huán)境中。塊盡量小而薄。塊的厚度以不超過(guò)5mm為宜,較為理想的厚度為2mm左右,主要目的是使固定液迅速而均勻的滲入塊內(nèi)部。勿使塊受擠壓。在采集過(guò)程中,應(yīng)盡量選擇較為鋒利的手術(shù),如手術(shù)刀片等,避免操作過(guò)程中擠壓挫傷標(biāo)本。擠壓過(guò)的均不可用。固定液的量一般以塊大小的20倍為宜,能夠在容器內(nèi)自由移動(dòng)。盡量保持的原有形態(tài)。新鮮經(jīng)固定后,或多或少產(chǎn)生收縮現(xiàn)象(如胃腸),為此可將展平,以盡可能維持原形。保持清潔。塊上如有血液、污物、粘液、食物、糞便等,可用生理鹽水沖洗,然后再入固定液,但要注意防止損傷。要熟悉采集部位。要能準(zhǔn)確的按解剖部位采集。
原理以慢病毒包裝為例,主要包括3個(gè)質(zhì)粒:質(zhì)粒DNA可以轉(zhuǎn)錄出慢病毒遺傳物質(zhì)(RNA),但不能翻譯出慢病毒的外殼及蛋白成分的載體質(zhì)粒,其同時(shí)含有目的基因和報(bào)告基因,psPAX2是可以表達(dá)慢病毒外殼的質(zhì)粒,其表達(dá)產(chǎn)物可通過(guò)粘附機(jī)制更易穿過(guò)細(xì)胞膜。為慢病毒的膜蛋白質(zhì)粒,通過(guò)脂質(zhì)體進(jìn)行三質(zhì)粒共轉(zhuǎn)到靶細(xì)胞基因組中,宿主基因組在表達(dá)時(shí),隨宿主基因轉(zhuǎn)錄出的目的基因RNA與psPAX2、基因翻譯出的蛋白組裝為慢病毒。病毒進(jìn)入細(xì)胞后,其遺傳物質(zhì)RNA逆轉(zhuǎn)錄出DNA,該基因再整合到靶細(xì)胞的基因組中,完成轉(zhuǎn)染過(guò)程。因?yàn)橘|(zhì)粒DNA只能轉(zhuǎn)錄出病毒RNA和表達(dá)目的基因卻不能表達(dá)出病毒的外殼和膜蛋白成分,因此其不能像普通的病毒一樣在宿主細(xì)胞能反復(fù)增殖,故對(duì)宿主細(xì)胞是無(wú)害的并且高效的將目的基因轉(zhuǎn)染到靶細(xì)胞基因組中。用途病毒產(chǎn)生,包裝病毒。材料與儀器無(wú)菌1×PBS,對(duì)數(shù)期293T細(xì)胞,細(xì)胞計(jì)數(shù)器,病毒質(zhì)粒(以慢病毒為例:psPAX2/),轉(zhuǎn)染試劑(lipMax或者lipo3000),Polybrene、病毒濃縮液(生物公司有售)等。步驟(1)293T細(xì)胞鋪板取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的293T細(xì)胞,用的胰蛋白酶消化293T細(xì)胞,計(jì)數(shù)。若是10cm大皿,建議按照10-12×106每皿的數(shù)量將293T細(xì)胞均勻鋪入。若是6孔板。protocol 分享|小鼠卵巢組織切片 HE 染色。
m6A研究又有新手段了?趕緊來(lái)了解一下吧!欄目:研究動(dòng)態(tài)發(fā)布時(shí)間:2019-08-14RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章......RNA甲基化m6A是如今的研究熱點(diǎn)之一,目前主要的研究思路包括差異表達(dá)的write,reader和eraser基因分析;m6A抗體檢測(cè)全轉(zhuǎn)錄組甲基化水平;分析m6A甲基化水平變化的靶基因和下游機(jī)制研究。而在7月25日的Cell上新發(fā)表了一篇介紹不使用m6A抗體的檢測(cè)mRNAm6A水平的Resource文章,小編時(shí)間和大家分享一下。作者開(kāi)發(fā)這一方法的前提是有研究報(bào)道了MazF能特異性的識(shí)別無(wú)修飾的ACA序列并發(fā)揮RNA酶活性在ACA之前剪切底物。但ACA序列的個(gè)A發(fā)生m6A甲基化之后將無(wú)法被MazF所識(shí)別,如圖一所示。圖1MazFRNA酶作用示意圖根據(jù)這一原理,作者將純化后的mRNA進(jìn)行MazF酶處理,然后再對(duì)打斷的RNA進(jìn)行逆轉(zhuǎn)建庫(kù)測(cè)序。對(duì)于無(wú)修飾的位點(diǎn),ACA處被完全剪切,測(cè)序reads正好分布于該位點(diǎn)上下游而且比對(duì)至該處的上下游reads數(shù)是相同的.如圖2所示。而甲基化位點(diǎn)的reads會(huì)包含上下游的序列。作者開(kāi)發(fā)了MAZTER-MINE軟件包專(zhuān)門(mén)進(jìn)行分析(圖3)。維持細(xì)胞內(nèi)外環(huán)境的穩(wěn)定。細(xì)胞質(zhì)是細(xì)胞內(nèi)的液體,其中包含了各種細(xì)胞器和細(xì)胞骨架等結(jié)構(gòu)。寧夏疾病模型科研技術(shù)服務(wù)實(shí)驗(yàn)室
這種技術(shù)是將蛋白質(zhì)視為抗原,并利用抗體與之進(jìn)行特異性結(jié)合的特性,來(lái)進(jìn)行研究。寧夏小鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)
在人類(lèi)疾病研究中數(shù)據(jù)表明,常用實(shí)驗(yàn)動(dòng)物模型按產(chǎn)生原因分為以下5類(lèi):自發(fā)性動(dòng)物模型、誘發(fā)型動(dòng)物模型、遺傳工程動(dòng)物模型、生物醫(yī)學(xué)動(dòng)物模型和陰性動(dòng)物模型。下面上海研錄帶大家一起看看吧:1、自發(fā)性動(dòng)物模型:是指動(dòng)物未經(jīng)任何有意識(shí)的人工處理,在自然條件下或基因突變條件下所產(chǎn)生的疾病模型。主要包括突變型的遺傳病模型和近郊系的疾病模型。2、誘發(fā)型動(dòng)物模型:亦稱(chēng)實(shí)驗(yàn)性動(dòng)物模型。是使用物理、化學(xué)或生物致病因素誘導(dǎo)動(dòng)物產(chǎn)生某些類(lèi)似人類(lèi)疾病表現(xiàn)而制備的動(dòng)物模型。此模型具有制備方法簡(jiǎn)單,實(shí)驗(yàn)條件容易控制,重復(fù)性好等特點(diǎn),廣泛應(yīng)用于藥物篩選、毒理、傳染病、病理機(jī)制的研究。3、遺傳工程動(dòng)物模型:是利用遺傳工程技術(shù)對(duì)動(dòng)物基因組進(jìn)行修飾,用于研究基因功能或疾病機(jī)制的動(dòng)物模型。也稱(chēng)基因修飾動(dòng)物模型,是指利用胚胎工程和基因工程等生物技術(shù)有目的的干預(yù)動(dòng)物的遺傳組成,導(dǎo)致動(dòng)物出現(xiàn)新的性狀,并使其能夠有效地遺傳下去,形成新的可供生命科學(xué)研究的和其他目的所用的動(dòng)物模型。4、生物醫(yī)學(xué)動(dòng)物模型:也是指利用健康生物的特定生物學(xué)特征,研究人類(lèi)疾病相似表現(xiàn)得模型。這類(lèi)動(dòng)物模型與人類(lèi)疾病存在一定的差異,研究者應(yīng)加以比較,從中獲得有關(guān)材料。寧夏小鼠科研技術(shù)服務(wù)服務(wù)